library(dplyr)
vect_fa_temps_complet <- c('01','01D','01S','01P','02','03','04','05','06','07')
rps_episode_soin_continu <- psy_rps$rps %>%
dplyr::select(forme_activite,no_ipp,no_sejour,date_debut_sequence,date_fin_sequence,nb_jours_presence) %>%
dplyr::filter(forme_activite %in% vect_fa_temps_complet) %>%
dplyr::group_by(no_ipp) %>%
dplyr::arrange(date_debut_sequence, .by_group = TRUE) %>%
dplyr::mutate(same_episode_soin_continu_ipp = as.integer(date_debut_sequence-dplyr::lag(date_fin_sequence, default = date_debut_sequence[1])) <= 1L,
cumsum_episode_soin_continu_ipp = cumsum(!same_episode_soin_continu_ipp)+1L,
nb_episode_soin_continu_ipp = max(cumsum_episode_soin_continu_ipp)) %>%
dplyr::ungroup()
rps_episode_soin_continu
ipp_episode_soin_continu <- rps_episode_soin_continu %>%
dplyr::distinct(no_ipp,no_sejour,nb_episode_soin_continu_ipp) %>%
dplyr::mutate(.by = no_ipp, nb_sejour_ipp = dplyr::n()) %>%
dplyr::distinct(no_ipp,nb_sejour_ipp,nb_episode_soin_continu_ipp)
ipp_episode_soin_continu
Episodes de soin continu par IPP
Introduction
Pour la définition des épisodes de soin continu en hospitalisation complète, voir ici
Dans un premier tibble, sur la base des RPS de temps complet, on repère et comptabilise par IPP, les épisodes de soin continu.
Dans un second tibble, on calcule par IPP le nombre de séjours temps complet et le nombre d’épisodes de soin continu.
Code
Commentaires
Ligne 3 : le vecteur vect_fa_temps_complet
correspond aux codes des formes d’activité temps complet
Ligne 5 : psy_rps$rps
est un tibble des variables de la partie fixe d’un fichier RPS
Ligne 9 : l’argument .by_group = TRUE
dans le dplyr::arrange()
permet de trier au sein d’un regroupement.
Lignes 10 à 12 : codage de l’algorithme de définition d’un épisode de soins continus
Pour aller + loin :
Repérage concomitant des épisodes de soin concentré (séquences séparées de 0 à 7 jours dans un même épisode)
Attribution d’une numérotation aux épisodes de soin continu
Etc …
Cette analyse est réalisée dans PMSISoft PSY dans l’écran Séjours > Base des séjours
avec, en particulier, le calcul du nombre d’épisodes de soin continu et du nombre d’épisodes de soin concentré.
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